Госпошлина, уплаченная при такой регистрации, учитывается для целей налогообложения прибыли в следующем порядке. Если госпошлина уплачена до введения транспортного средства в эксплуатацию, ее следует включить в первоначальную стоимость этого транспортного средства. Если госпошлина уплачена после введения транспортного средства в эксплуатацию, ее следует учитывать в составе прочих расходов, связанных с производством и реализацией (см. письмо Минфина России от 24.07.2018 № 03-03-06/3/51800).
Разъяснения поддерживаются в учетных решениях "1С:Бухгалтерия 8 (ред. 3.0)".